Oprogramowanie sklepu posiada dwustronną integrację z Allegro.pl.
Sklep internetowy na oprogramowaniu sStore posiada pełną integrację z serwisem Allegro.pl. Jeżeli produkt zostanie sprzedany w serwisie Allegro.pl to zamówienie wygeneruje się również w sklepie internetowym i produkt zostanie odjęty od stanów magazynowych w sklepie.
Sklep potrafi również aktualizować stany magazynowe w aukcjach Allegro, gdy klient kupi produkt w sklepie, jednak do czasu, gdy na Allegro pojawią się oferty kupna. Wtedy Allegro nie pozwoli na wprowadzenie zmian w aukcji.